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小編的世界 優質文選 生物
發表文章的微生物組學數據往哪兒交？
字體大小：
2020年8月20日 -
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中國科學院微生物研究所
中心官方網站鏈接：http://nmdc.cn/
，打開網站主頁：
感受數據提交服務亮點：
線上全流程數據匯交，為您帶來便捷提交新體驗
便捷數據提交 專業團隊審核 快速數據發表
l 支撐中國科學家發表文章時的數據存儲、共享。
l 支持微生物項目、樣本、核酸序列、微生物基因組、宏基因組、微生物元基因組、轉錄組、蛋白質結構、期刊附件等多種類型數據提交。
l 支持國家重點研發計劃、科技資源調查專項、國際合作專項等項目數據匯交。
l 數據當日提交三個工作日內完成審核並發放編號。
l 為每條數據提供DOI編號。
（圖例來源為國家微生物科學數據中心數據提交頁面）
國家微生物科學數據中心發布的數據編號，獲得國際國內期刊認可：
可以支持我國科學家在《Nature》、《Science》、《Lancet》等國際著名期刊上發表文章時直接使用
：
（圖例來源：《柳葉刀》）
同樣也支持在國內期刊發表文章時使用：
（圖例來源：《生物工程學報》官網）
提交到國家微生物科學數據中心NMDC的數據可以選擇多種共享方式，可以選擇完全公開數據使用，也可以選擇為協議公開。
（圖例來源為國家微生物科學數據中心協議公開新冠數據）
如果期刊要求作者提交文章附件（如圖片、表格、音頻、視頻或其他格式文件等），也可以在數據提交頁面進行期刊附件數據的上傳。
（圖例來源為國家微生物科學數據中心完全公開期刊附件數據）
NMDC網站可提交的數據類型共八種。包括生物項目數據（BioProject），即生物學研究項目信息進行收集整理的數據庫，可以根據所產生的數據類型來識別一個項目；生物樣本數據（BioSample）為一個中心位置，可與項目庫鏈接，也可獨立，用於收集病毒、細菌、真菌等微生物的菌株及樣本、微生物環境樣本（元基因組）描述信息；核酸序列數據（NucleotideSeq）收集16S rRNA、rRNA-ITS等特征基因片段以及其他微生物相關的核酸序列；原始組學數據（MSRA）收集管理測序產生的原始數據集；晶體結構數據（Structure）收集生物大分子(蛋白質、核酸等）的結構數據；期刊附件數據（Attchment）為生物學期刊提供文章的在線提交附件數據；基因組數據（Genome）收集拼接組裝完整的基因組數據信息；宏基因數據（Metagenome）收集微生物宏基因組相關數據信息。各類數據之間采用線性、一對多、多對一的模式進行關聯，從而形成“金字塔”式的信息組織與管理模式。
如何提交數據到NMDC？
01
注冊用戶
在NMDC網站第一次進行數據提交時需要先注冊個人賬戶，按網站要求及個人真實情況填寫即可，注冊成功之後即可開始提交數據。
02
創建數據
創建生物項目
創建所有數據的第一步就是建立一個項目，項目是一個研究的總集合，其中可包含多個樣本及數據，大多情況下創建數據的順序為先建立一個項目，之後建立一個樣本與此項目連接，之後建立的原始數據、基因組數據等再分別與項目和樣本連接，這樣，一個完整的與實驗相關的數據匯交就完成了。
創建項目共有六個步驟，第一個步驟為填寫提交人，聯系人信息等，如果此數據由多方人員提供，可添加多個提交人和機構，其中姓名，郵箱及聯系電話要准確填寫，這些使我們可以用來及時聯系用戶。
第二步為填寫項目數據類型，樣本範圍類型。項目數據類型表示之後進行提交的是什麼數據，分為組裝/拼接、基因組測序、基因組測序與組裝/拼接、宏基因組、宏基因組組裝、轉錄組或基因表達、靶位點、培養的靶位點、靶位點外周、原始序列讀長、其他共11種，可多選；樣本範圍類型則表示此樣本的屬性，有單來源分離株、多來源分離株、多物種、環境、合成物、其他共6種，需選擇其中一個。
第三步為填寫研究對象信息。其中物種名稱需准確填寫物種學名，如果數據不是單一物種的，就填寫屬名等信息。
第四步為填寫基本信息。發布日期可選：審核後立即發布、期刊發布同步、指定日期發布可選擇指定日期。項目標題填寫，如果是單一物種可填寫此物種學名加上項目數據類型，如果此項目含多個物種多種數據，就填寫一個簡短但明確的介紹，涉及領域此數據涉及的方面，有農業、醫學、工業、環境、進化、模式生物、其他共7種，選擇其中一個。
第五步為鏈接生物樣本，如果有樣本輸入樣本編號即可，如果沒有可以跳過，之後再建立樣本時連接項目即可。
第六步為填寫文章與基金，如果有關聯文章則需要准確填寫文章狀態，期刊名稱，文章標題，且可在此添加文章，如果沒有則選擇否即可；如果有關聯基金則需要准確填寫基金類別、基金名稱、基金編號，可添加多個。另外最後要選擇數據訪問協議類型，其中完全公開數據使用表示任何用戶都可以訪問、複制、手機和下載，而協議公開示用則表示用戶使用此類數據時需征得數據提供者同意，點擊選擇後需遵從此協議。
全部填寫完成後可以對自己填寫的數據進行整體預覽，如果檢查無誤即可點擊提交，系統核驗後會給用戶發送正式編號，此編號用於後期提交的數據與此項目進行連接。這樣一個生物項目就創建成功了~
後續我們將持續推送生物樣本數據、核酸序列數據、原始組學數據、基因組數據、宏基因數據、晶體結構數據、期刊附件數據的詳細提交步驟，敬請關注。
官網：http://nmdc.cn/
地址：北京市朝陽區北辰西路一號院3號 中國科學院微生物研究所
電話：010-64807385
郵箱：nmdc@im.ac.cn
Q Q：3415782117